小儿推拿的最佳时间因个体差异，年龄大小，病情轻重的程度不同而不同。
小儿推拿按摩针对不同的位置有不同的效果，而不同的位置所推拿的时间也可能不一样，有的小儿年龄太小，不能承受长时间的推拿。所以根据不同的情况，以下列出了不同的推拿最佳时间：
(1)根据小儿年龄不同：一岁以下的小儿年龄较小，身体较为柔弱，按摩时手法应轻柔，时间应不超过一分钟。
(2)根据小儿病情不同：病情较轻的小儿一天推拿一次即可，病情较重的小儿一天可能需要多次推拿。
(3)根据小儿病情性质不同：患有慢性病的小儿，需要以三天，一星期，或者十天为一个疗程，间断推拿治疗。若只是为了保健按摩，则每天一次，或者隔一天一次即可。
(4)为了消除小儿对于推拿的恐惧，应该在推拿的同时转移小儿的注意力，可在小儿看电视时进行推拿。
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